大蒜种质遗传多样性的SSR分析

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摘要 为了探索中国大蒜种质个体的SSR位点的分布情况，为品种鉴定、保存及遗传改良提供分子生物学依据，利用6对SSR引物对40个大蒜(Allium sativum L.)品种进行聚类分析、主成分分析及遗传多样性评价。共检测到21个多态性位点，平均每对引物可扩增出约3.5条多态性片段，多态性百分率为56.76%；SSR引物组合平均有效等位基因数、Nei基因多样度和Shannon信息指数分别为1.5551、0.3414和0.5188。聚类分析显示，6对SSR引物可把40份大蒜种质资源从0.59相似系数水平上3个类群。第一类群包含28份种质，在相似系数为0.73的水平上进一步又被分成了3个亚类；第二亚类仅包含2份种质；第三亚类包含10份种质，在0.68的相似系数水平上分成了2个亚类。主成分分析和UPGMA的结果基本一致。不同地理来源的大蒜种质的Shannon-Weaver多样性指数的变幅为0.0576~0.4179，说明大蒜种质遗传多样性丰富。本研究利用 SSR分子标记技术较准确地解析大蒜不同材料间的亲缘关系及遗传多样性，为中国大蒜SSR分子标记提供基础资料。     服务  
 

[1]   游慧, 向珣朝, 杨博文, 黎怀成, 许亮, 龙跃腾. 重穗型变异材料爪哇稻22的生理性状和遗传特性[J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(6): 961-971.  
[2]   刘阳杰, 何美敬, 崔顺立, 杨鑫雷, 穆国俊, Charles Y CHEN, 刘立峰. 美国花生种质资源果腐病抗性分子标记的筛选及分析[J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(4): 743-751.  
[3]   杭芸, 俞金健, 周世水, 程健弘, 黄华宏, 林二培, 童再康. 杉木木材形成功能基因内SSR标记的开发及应用[J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(1): 34-42.  
[4]   周晓君, 王海亮, 李方玲, 张凯, 王俞娜, 押辉远. 基于RAD-seq技术开发灵宝杜鹃多态性SSR标记[J]. 农业生物技术学报, 2019, 27(1): 55-62.  
[5]   孙瑞 王桂霞 常琳琳 孙健 董静 钟传飞 石琨 张运涛. 草莓分子标记技术发展与应用[J]. , 2018, 26(9): 1588-1600.  
[6]   朱华平 苏换换 马冬梅 黄樟翰. 华南鲤选育品种与地方品种的遗传多样性比较分析[J]. , 2018, 26(8): 1371-1381.  
[7]   沙君雪 迟宝岩 张金波 李阳阳 史琛琛 倪鹤嘉 李海涛 高继国. 大猿叶甲转录组测序及生物学信息分析[J]. , 2018, 26(6): 978-986.  
[8]   王凤格 李欣 易红梅 江彬 任洁 王璐 霍永学 王蕊 葛建镕 杨杨 赵久然. 适于二碱基重复类型SSR引物指纹分析的连续多峰算法[J]. , 2018, 26(6): 1004-1013.  
[9]   陆云峰 杨安娜 张俊红 楼炉焕 黄华宏 童再康. 紫楠转录组EST-SSR标记开发及通用性分析[J]. , 2018, 26(6): 1014-1024.  
[10]   刘栓桃 张志刚 王立华 王荣花 李巧云 陈伟 赵智中 张全芳 梁水美 王淑芬. 主要大白菜品种及种质资源在eIF(iso)4E.a和eIF(iso)4E.c位点的基因型精准鉴定[J]. , 2018, 26(5): 888-898.  
[11]   梁邦平 郝冬冬 刁慧珊 李家创 袁凤平 李毛 武军 赵继新 陈新宏. 小麦-黑麦1BL/1RS易位系7-1抗纹枯病的分子细胞学鉴定[J]. , 2018, 26(4): 711-718.  
[12]   张思妮 王震 赵丹阳 夏雪娇 翟晓光 张拓 杨二航 丁勤 马翎健. 人工合成小麦农艺性状与SSR标记的关联分析[J]. , 2018, 26(4): 564-575.  
[13]   赵方媛 李冬梅 田新会 杜文华. 饲草型小黑麦遗传图谱的构建及抗条锈QTL定位[J]. , 2018, 26(4): 576-584.  
[14]   赵丽丽 王普昶 张宇君 宋高翔 余青青. 白刺花辐射诱变M2代突变群体的形态特征比较和ISSR分析[J]. , 2018, 26(10): 1698-1706.  
[15]   陈伯伦 张 晋 黄继魁 黄诚梅 周秋娟 陶 伟 唐娟. SCoT分子标记在猕猴桃遗传多样性分析与变异鉴定上的应用[J]. , 2018, 26(1): 77-86.